Rcpp 函数在打包时使 RStudio 崩溃

Rcpp function crashes RStudio when packaged

本文关键字:RStudio 崩溃 包时使 函数 Rcpp      更新时间:2023-10-16

我使用带有单个函数的Rcpp.package.skeleton(myPackage)构建了一个虚拟的 Rcpp 包:

// [[Rcpp::export]]
double triple_balance(const double& balance) {
if(R_IsNA(balance)) {
stop("balance is NA, please provide a numeric value");
} else {
double result = balance*3;
return result;
}
}

在单元测试中,我想确保该函数在传递错误的输入时返回错误,如果我提供它,它会始终这样做:

Rcpp::sourceCpp('src/triple_balance.cpp')
triple_balance("10")

triple_balance("10"( 中的错误: 与请求的类型不兼容:[类型=字符;目标=双精度]。

但是,如果我安装并重新启动软件包,则运行triple_balance("10")会使 RStudio 崩溃。我应该补充一点,崩溃不会每次都发生,它似乎取决于库的初始状态,例如我之前是否安装了以前版本的包,例如在函数定义中是否带有const

什么可以解释这种不一致的行为?

我的sessionInfo

> sessionInfo()
R version 3.6.0 (2019-04-26)
Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit)
Running under: Red Hat Enterprise Linux Server 7.8 (Maipo)
Matrix products: default
BLAS/LAPACK: /usr/lib64/R/lib/libRblas.so
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
[9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
other attached packages:
[1] rcppDummy_1.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.6.0 tools_3.6.0    Rcpp_1.0.2     packrat_0.5.0 

在用例中

Rcpp::sourceCpp('src/triple_balance.cpp')
triple_balance("10")

错误是你的,因为当你的界面正在使用double

double triple_balance(const double& balance)

这不是你输入"10"时提供的 - 这是一个字符 矢量(或"字符串"(!

如果你使用向量参数,你可以用 Rcpp 自动捕捉到这一点:

// [[Rcpp::export]]
NumericVector triple_balance(const NumericVector & balance) {
return balance * 3;
}

现在,这将检查何时实例化 Rcpp 数据结构:

R> triple_balance(10)
[1] 30
R> triple_balance(10L)
[1] 30
R> triple_balance("10")
Error in triple_balance("10") : 
Not compatible with requested type: [type=character; target=double].
R> 

最重要的是,它可以在向量上自动工作:

R> triple_balance(c(c(2,3), seq(10,30,by=10), log10(1:3)))
[1]  6.00000  9.00000 30.00000 60.00000 90.00000  0.00000  0.90309  1.43136
R> 

并且还处理非有限值:

R> triple_balance(c(10, NA, NaN, Inf, -Inf))
[1]   30   NA  NaN  Inf -Inf
R> 

编辑顺便说一句,如果我将您的版本保留在源文件中并附加_orig,它对我来说也可以正常工作(Ubuntu 20.04;当前的 Rcpp(

R> triple_balance_orig("10")
Error in triple_balance_orig("10") : 
Not compatible with requested type: [type=character; target=double].
R> packageVersion("Rcpp")
[1] ‘1.0.4.11’
R> 

这种行为不是新代码,所以我有点惊讶它会让你的 RHEL 安装崩溃。

编辑2:为了论证,我也把它做成一个包,它也不会让RStudio崩溃。 我正在运行最新的测试版本 1.4.390。(我已经看到在重新编译软件包和错误时出现这样的崩溃,它可能会发生。 它不应该在这里发生。

您可以在 https://rstudio.cloud 中尝试您的代码,以快速尝试不同的环境。