C++ HDF5 提取复合数据类型的一个成员

C++ HDF5 extract one member of a compound data type

本文关键字：一个 成员 HDF5 提取 复合 数据类型 C++      更新时间：2023-10-16

我正在编写一个 c++ 库，用于读取另一个库生成的 hdf5 文件。

这些hdf5文件包含许多具有各种复合数据类型的复合数据集。我希望将每个复合数据类型转换为C++结构。

对于字符串（可变长度或固定大小的字符数组），我想在C++结构中使用 std：：string。

目前，我使用中间 C 结构（使用 char* 或char[]变量），然后将其转换为最终的 C++ 结构。但是，这会导致大量样板代码。

如果我可以按成员提取数据，我可以执行以下操作：

std::string name = extract<std::string>(d,"name");

其中 d 是复合数据集。

可能吗

我找到了一个可行的解决方案。我把它贴在这里，也许有人会发现它很有用。这个想法是创建一个CompoundExtractor对象，其中包含一个缓冲区，其中读取整个化合物。然后，可以使用模板提取方法逐个提取成员。在此阶段，适当的专用化（此处未报告）允许对字符串进行适当的处理。问候

struct MADNEX_VISIBILITY_EXPORT CompoundExtractor
{
  /*!
   * brief constructor
   * param[in] d: data set
   */
  CompoundExtractor(const DataSet&);
  //! destructor
  ~CompoundExtractor();
  /*!
   * return a member of the compound of the given type
   * param[in] n: member name
   */
  template<typename T>
  T extract(const std::string&) const;
  /*!
   * return a member of the compound of the given type
   * param[in] n: member name
   */
  template<typename T>
  T extract(const char *) const;
private:
  //! the description of the compound data type
  H5::CompType ctype;
  //! an intermediate storage for the compound data type
  std::vector<char> data;
}; // end of CompoundExtractor
template<typename T>
T CompoundExtractor::extract(const char *n) const{
  const auto i = this->ctype.getMemberIndex(n);
  const auto o = this->ctype.getMemberOffset(i);
  return *(reinterpret_cast<const T *>(this->data.data()+o));
} // end of CompoundExtractor::extract
template<typename T>
T CompoundExtractor::extract(const std::string& n) const{
  const auto i = this->ctype.getMemberIndex(n);
  const auto o = this->ctype.getMemberOffset(i);
  return *(reinterpret_cast<const T *>(this->data.data()+o));
} // end of CompoundExtractor::extract
CompoundExtractor::CompoundExtractor(const DataSet& d)
{
  const auto dtype = d.getDataType();
  if(dtype.getClass()!=H5T_COMPOUND){
    throw(std::runtime_error("CompoundExtractor: invalid data set"));
  }
  this->ctype = H5::CompType(d);
  this->data.resize(ctype.getSize());
  d.read(this->data.data(),ctype);
}
CompoundExtractor::~CompoundExtractor() = default;
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