在 Python-C++-C-Fortran 2003 程序中链接英特尔的 MKL

Linking Intel's MKL within Python-C++-C-Fortran 2003 program

本文关键字：英特尔 MKL 链接 Python-C++-C-Fortran 2003 程序      更新时间：2023-10-16

我正在尝试链接一个性质非常复杂的程序：

  • 在Linux Fedora下开发和运行
  • 用fortran 2003编写的主要代码在很大程度上依赖于英特尔的MKL库和少量的ANSI C代码
  • 它有C++接口(使用iso_C_binding)
  • 通过boost.python从python访问c++接口

在运行时，我得到以下文本

MKL FATAL ERROR: Cannot load neither libmkl_avx.so nor libmkl_def.so

之后程序停止。

我已经检查了libmkl_avx.so和libmkl_def.so都在$LD_LIBRARY_PATH中

最后的链接是通过完成的

g++ -g3 -shared -Wl,-soname,libFrrBoost_rt.so interfejs.o t83.o gen_random2.o 
-L/opt/intel/composerxe/mkl/lib/intel64 -lpython2.7 -lifport -lifcore -lboost_python     
-Wl,--start-group -lmkl_sequential -lmkl_intel_lp64 -lmkl_core  -Wl,--end-group 
-o libFrrBoost_rt.so

libFrrBoost是链接的模块，然后是

运行导入模块libFrrBoost的python t83.py(特别是链接器在准备二进制文件时不会抱怨)会导致错误。

尝试过谷歌搜索。我发现的所有信息都与用C/Fortran编写的"常用程序"有关，其中包括英特尔的MKL。我能够毫无问题地运行这类程序。我认为Makefile中链接行的MKL部分在这两种情况下都是等效的，但肯定有一个隐藏的谜团。问题通常是链接不好——我认为这不适用(库与英特尔手册中的完全一样——接口、线程和计算库都是非常标准的)

使用过的编译器：

ifort 12.1.0，icpc 12.1.0，python-python 2.7.1，icc 12.1.0(小C代码段也调用MKL，但是)

编辑(由于Hirsto Iliev的评论)

我已经用这种方式运行了strace：strace python t83.py；结果是(在转储libmkl:之后

open("/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mkl/lib/intel64/libmkl_avx.so", O_RDONLY) = 3
open("/usr/bin/libmkl_avx.so", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/opt/slurm-2.2.5/lib/libmkl_avx.so", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/compiler/lib/intel64/libmkl_avx.so", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/debugger/lib/intel64/libmkl_avx.so", O_RDONLY) = -1 ENOENT (No such file or directory)
open("/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/mkl/lib/intel64/libmkl_avx.so", O_RDONLY) = 3

我知道open的规范在这里是一样的，特别是，因为3，4是正的，表明open已经找到了一个文件，并为它分配了文件描述符。我已经确认该文件确实存在于该位置。

这也是"好"的英特尔编译器目录作为：

czeslaw@stefan:~/prog/FoCpy3 $ which ifort
/opt/intel/composer_xe_2011_sp1.7.256/bin/intel64/ifort

所以版本是一样的——显然这不是版本问题。

libmkl_def.so的一切都是一样的。

免责声明：虽然我听起来对自己写的东西很有信心，但我不是。每句话都应该以"如果我没有错的话"开头。

英特尔网站上提出的For me解决方案运行良好

export LD_PRELOAD=/opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_core.so:/opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_sequential.so

这似乎是某种虫子。

似乎解决方案是与-lmkl_rt而不是-lmkl_sequential -lmkl_intel_lp64 -lmkl_core链接。我不明白为什么一方要给予另一方优势。我很困惑，但这(到目前为止)有效。

edit英特尔人员声称这是MKL库错误。

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