Anaconda ImportError: /usr/lib64/libstdc++.so.6: 找不到版本 'GLIBCXX_3.4.21'

Anaconda ImportError: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.21' not found

本文关键字:GLIBCXX 找不到 lib64 usr ImportError libstdc++ so Anaconda 版本      更新时间:2023-10-16

当我尝试在 conda 环境中运行 Python 脚本时,我收到以下导入错误

(squad) azada@scholar-fe00:~/Desktop/Toy-Problem-Team-2 $ python3 train.py 
Traceback (most recent call last):
File "train.py", line 21, in <module>
from tensorboardX import SummaryWriter
File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/__init__.py", line 5, in <module>
from .torchvis import TorchVis
File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/torchvis.py", line 11, in <module>
from .writer import SummaryWriter
File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/writer.py", line 15, in <module>
from .event_file_writer import EventFileWriter
File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/event_file_writer.py", line 28, in <module>
from .proto import event_pb2
File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/tensorboardX/proto/event_pb2.py", line 7, in <module>
from google.protobuf import descriptor as _descriptor
File "/home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/google/protobuf/descriptor.py", line 47, in <module>
from google.protobuf.pyext import _message
ImportError: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.21' not found (required by /home/azada/miniconda3/envs/squad/lib/python3.6/site-packages/google/protobuf/pyext/_message.cpython-36m-x86_64-linux-gnu.so)

编写strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX命令具有以下输出

GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.1
GLIBCXX_3.4.2
GLIBCXX_3.4.3
GLIBCXX_3.4.4
GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.6
GLIBCXX_3.4.7
GLIBCXX_3.4.8
GLIBCXX_3.4.9
GLIBCXX_3.4.10
GLIBCXX_3.4.11
GLIBCXX_3.4.12
GLIBCXX_3.4.13
GLIBCXX_3.4.14
GLIBCXX_3.4.15
GLIBCXX_3.4.16
GLIBCXX_3.4.17
GLIBCXX_3.4.18
GLIBCXX_3.4.19
GLIBCXX_DEBUG_MESSAGE_LENGTH

如您所见,所需的libgcc版本不存在。但是我不明白为什么python要在/usr目录中寻找GLIBCXX

在我的 anaconda 环境的libstdc++.so.6上运行相同的命令表明文件中存在所需的版本。

我正在使用我大学的计算集群,所以我没有管理员权限。

有什么方法可以让 Python 使用我的 conda 环境的libstdc++而不是/usr目录中的?

我花了一天的时间研究这个问题,在我的研究型大学的计算集群上遇到了与您相同的规格的完全相同的问题,我终于找到了正确的堆栈溢出线程。不幸的是,上述答案在这里都不起作用,但我可以非常自信地说,即使错误回溯的来源不同,链接线程中的详细信息也应该可以解决您的问题。

总而言之,您需要将路径添加到anacondatoLD_LIBRARY_PATHlib文件夹:

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/your/path/to/conda/env/lib

就我而言,我只是做了:

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:~/anaconda3/lib

。它就像一个魅力!

这也值得一试,因为它最终对我有用:

conda install -c conda-forge libstdcxx-ng

说明:我在尝试import tensorflow as tf时收到此错误:

ImportError: /opt/conda/bin/../lib/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.30' not found (required by /opt/conda/lib/python3.8/site-packages/tensorflow/python/_pywrap_tensorflow_internal.so)

我已经安装了libgcc-ng。还值得注意的是,我已经添加了附加到LD_LIBRARY_PATH的 conda 库路径和系统库路径,但这对我不起作用。所以,YMMV。

通过降级到 libgcc==5.2.0 来解决它

最初,尝试使用 pip 安装,但如果您收到错误:无法下载和编译 igraph 的 C 内核..通过conda安装它

运行此代码,您的问题应该得到解决,

conda install -c conda-forge gcc