从 for 循环的每次迭代创建一个新变量

我正在尝试编写一个需要两个字符串的函数：一个是细菌的"基因组"，例如ATACGAGA或类似的东西。 另一串是DNA序列，例如必须在基因组中找到的ATA。 该函数应该返回它在将DNA序列与基因组进行比较时发现的最佳相似性分数。 因此，由于 ATA 是 3 个字符，它会将 ATA 与基因组中的前三个字符进行比较，然后是第二、第三和第四个字符，然后是第三、第四和第五个字符，依此类推。 由于ATA是基因组的前三个字符，因此相似性得分为1。 例如，如果我正在寻找的子字符串是 ATG，因为 2/3 的字符相同，它将返回 0.66。

到目前为止，我的函数准确地返回第一个 for 循环每次迭代的 simScore。 例如，如果基因组串是ABCABC，子串是ABC，它会准确地计算i=0处的simScore为1，i=3为1，因为ABC与这些位置的基因组完全匹配。 但是，要找到最佳的simScore，我需要以某种方式找到for循环每次迭代的simScore，并且： 1. 每次迭代都将其与之前的simScore进行比较，并始终保持较高的simScore，或者 2：将每个新的simScore存储在一个新变量中，然后比较所有simScore以确定最高的一个。

double findBestSimScore(string genome, string sequence)
{
double simScore; // similarity score for the genome and the substring
double newSimScore;
double bestSimScore;
int differences = 0;
if(genome == "" || sequence == "")
{
return 0;
}
else if(genome.length() < sequence.length())
{
return 0;
}
else
{
for(int i = 0; i < genome.length(); i++)
{
string sub = genome.substr(i, sequence.length()); 
differences = 0;

for(int c = 0; c < sequence.length(); c++)
{
if(sub[c] != sequence[c])
{
differences++;
}
}
simScore = (sequence.length() - differences) / (sequence.length() * 1.0); // This calculation needs to be done in each iteration of the first for loop and stored as a new variable, or 
                // It could also work if each time the simScore is calculated, it is compared to the previous simScore to see if it is larger
}
/*
Need if else statements here that compare each simsScore and determine the highest simScore
*/
return bestSimScore;
}
}
int main()
{
//test 1 
//
cout << findBestSimScore("ABCABC", "ABT") << endl;