使用 Rcpp 和 typedef 时出现编译错误

Compilation error using Rcpp with typedef

本文关键字:编译 错误 Rcpp typedef 使用      更新时间:2023-10-16

我正在使用RcppEigen为我的R包编写一些C++组件,并且在这种情况下使用typedefs时遇到问题。以下代码无法编译:

// [[Rcpp::depends(RcppEigen)]]
#include <RcppEigen.h>
using namespace Rcpp;
typedef Eigen::ArrayXd MapAr1;
// [[Rcpp::export]]
MapAr1 myFun(const MapAr1& x){
  MapAr1 y = x;
  y[0] = 0;
  return y;
}

这是错误:

==> Rcpp::compileAttributes()
* Updated src/RcppExports.cpp
* Updated R/RcppExports.R
==> devtools::document(roclets=c('rd', 'collate', 'namespace'))
Updating my_package documentation
Loading my_package
Re-compiling my_package
'/usr/lib64/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore  
  --quiet CMD INSTALL '/my_path/my_package'  
  --library='/tmp/RtmpgPjAdf/devtools_install_125071da0b53' --no-R --no-data  
  --no-help --no-demo --no-inst --no-docs --no-exec --no-multiarch  
  --no-test-load 
* installing *source* package ‘my_package’ ...
g++ -m64 -I/usr/include/R -DNDEBUG  -I/usr/local/include -I"/my_path/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/Rcpp/include" -I" /my_path/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/RcppEigen/include"   -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches   -m64 -mtune=generic  -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
** libs
RcppExports.cpp:10:1: error: ‘MapAr1’ does not name a type
 MapAr1 myFun(const MapAr1& x);
 ^
RcppExports.cpp: In function ‘SEXPREC* my_package_myFun(SEXP)’:
RcppExports.cpp:15:42: error: ISO C++ forbids declaration of ‘type name’ with no type [-fpermissive]
     Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP);
                                          ^
RcppExports.cpp:15:50: error: template argument 1 is invalid
     Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP);
                                                  ^
RcppExports.cpp:15:58: error: expected initializer before ‘x’
     Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP);
                                                          ^
RcppExports.cpp:16:40: error: ‘x’ was not declared in this scope
     rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(myFun(x));
                                        ^
RcppExports.cpp:16:41: error: ‘myFun’ was not declared in this scope
     rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(myFun(x));
                                         ^
make: *** [RcppExports.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘my_package’
* removing ‘/tmp/RtmpgPjAdf/devtools_install_125071da0b53/my_package’
Error: Command failed (1)
Execution halted
Exited with status 1.

相同的代码在包外部编译。所以我猜有些东西没有正确复制到 RcppExports 文件中。在尝试使用 RcppEigen 命名空间时,我还注意到一个类似的问题:using namespace RcppEigen;没有被复制。

知道如何在不手动修改 Rcpp 导出的情况下解决此问题吗?谢谢!

你坚持typedef让你的生活变得太复杂了。一旦你把它包含在文件中,你的函数签名,它就会成为接口的一部分,因此也需要在你的RcppExports.cpp中。 因此,您需要提供"更高一级"的服务。

但是有一个规定:调用文件pkgname_types.h,它将被包括在内。 我创建了一个简单的包eigentest,并在src/目录中添加了文件eigentest_types.h

#include <RcppEigen.h>
typedef Eigen::ArrayXd MapAr1;

然后将其添加到您的代码片段中

#include "eigentest_types.h"

而不是typedef.

这就是您所需要的 - 只需将eigentest替换为您的软件包名称即可。