Cygwin在Windows的上提供了一个POSIX兼容层。这肯定比针对本机操作系统CRT构建的代码要慢。

如果您的代码是标准C或C++，请使用MSVC或MinGW/GCC重新编译它，然后进行比较。

另一方面，malloc与new不是问题。堆分配非常昂贵。

可能重要的是，Windows堆分配通常比Linux的实现更昂贵。这种差异的影响取决于您的代码。

正如rubenvb所说，你不能真的说没有看到代码-但是：

内存量是不可预测的，可能是cygwin启动器或操作系统决定为cygwin作业分配大量内存，因为内存没有被使用。因此，cygwin应用程序未来的内存分配将更快。Linux报告内存使用情况的方式也有问题，它会进行视光分配，所以如果你分配了1Gb的内存，那么在使用之前，内存实际上不会锁定到该进程，并且任务不会显示为使用1Gb。

有些任务在Unix系统上非常便宜，但在Windows体系结构上非常慢。最臭名昭著的是fork（），它在Unix应用程序上很常见，但在Windows 上是个坏主意