如何在Sandy Bridge上的一系列int中快速计数位到单独的箱子中

How to quickly count bits into separate bins in a series of ints on Sandy Bridge?

本文关键字:箱子 单独 int Sandy Bridge 一系列      更新时间:2023-10-16

更新:请阅读代码,它不是关于计数位在一个int

是否有可能用一些聪明的汇编器来提高以下代码的性能?

uint bit_counter[64];
void Count(uint64 bits) {
  bit_counter[0] += (bits >> 0) & 1;
  bit_counter[1] += (bits >> 1) & 1;
  // ..
  bit_counter[63] += (bits >> 63) & 1;
}

Count在我的算法的最内层循环中。

更新:架构:x86-64, Sandy Bridge,所以可以使用SSE4.2, AVX1和更早的技术,但不能使用AVX2或BMI1/2。

bits变量几乎是随机的(接近一半的0和一半的1)

您可以尝试使用SSE,每次迭代增加4个元素。

警告:未测试的代码跟随…

#include <stdint.h>
#include <emmintrin.h>
uint32_t bit_counter[64] __attribute__ ((aligned(16)));
                     // make sure bit_counter array is 16 byte aligned for SSE
void Count_SSE(uint64 bits)
{
    const __m128i inc_table[16] = {
        _mm_set_epi32(0, 0, 0, 0),
        _mm_set_epi32(0, 0, 0, 1),
        _mm_set_epi32(0, 0, 1, 0),
        _mm_set_epi32(0, 0, 1, 1),
        _mm_set_epi32(0, 1, 0, 0),
        _mm_set_epi32(0, 1, 0, 1),
        _mm_set_epi32(0, 1, 1, 0),
        _mm_set_epi32(0, 1, 1, 1),
        _mm_set_epi32(1, 0, 0, 0),
        _mm_set_epi32(1, 0, 0, 1),
        _mm_set_epi32(1, 0, 1, 0),
        _mm_set_epi32(1, 0, 1, 1),
        _mm_set_epi32(1, 1, 0, 0),
        _mm_set_epi32(1, 1, 0, 1),
        _mm_set_epi32(1, 1, 1, 0),
        _mm_set_epi32(1, 1, 1, 1)
    };
    for (int i = 0; i < 64; i += 4)
    {
        __m128i vbit_counter = _mm_load_si128(&bit_counter[i]);
                                          // load 4 ints from bit_counter
        int index = (bits >> i) & 15;     // get next 4 bits
        __m128i vinc = inc_table[index];  // look up 4 increments from LUT
        vbit_counter = _mm_add_epi32(vbit_counter, vinc);
                                          // increment 4 elements of bit_counter
        _mm_store_si128(&bit_counter[i], vbit_counter);
    }                                     // store 4 updated ints
}

它是如何工作的:基本上我们在这里所做的就是对原始循环进行矢量化,这样我们每次循环迭代处理4位而不是1位。所以我们现在有16个循环迭代,而不是64个。对于每次迭代,我们从bits加载4位,然后将它们用作LUT的索引,LUT包含当前4位的4个增量的所有可能组合。然后将这4个增量加到bit_counter当前的4个元素上。

加载、存储和添加的数量减少了1/4,但这将在一定程度上被LUT加载和其他内务管理所抵消。你可能仍然会看到2倍的速度提升。如果你决定尝试一下,我很想知道结果。

也许你可以一次做8个,以8为间隔取8位,并保留8个uint64。每个计数器只有1个字节,所以你只能累积255个count调用,然后才能解包那些uint64。

看Bit Twiddling Hacks

  • 计数位设置
    • 计数位设置,朴素方式
    • 查找表设置的计数位
    • 计数位设置,Brian Kernighan的方式
    • 使用64位指令计数12位、24位或32位的字节
    • 计数位设置,并行
    • 从最高有效位到给定位置的位数设置(秩)
    • 选择给定计数(秩)的位位置(从最高有效位开始)

Edit至于"位位置桶积累"(bit_counter[]),我有一种感觉,这可能是一个很好的valarrays + masking案例。这将是相当多的编码+测试+分析。如果你真的感兴趣,请告诉我。

现在,你可以使用绑定元组 (TR1, boost或c++ 11)来实现非常接近valarray的行为;我有一种感觉,它会变得更容易阅读,更慢编译。

显然这可以用"垂直计数器"快速完成。来自@steike:

关于比特技巧(存档)的现已关闭的页面

考虑一个普通的整数数组,我们读取其中的位水平:

       msb<-->lsb
  x[0]  00000010  = 2
  x[1]  00000001  = 1
  x[2]  00000101  = 5

一个垂直计数器存储数字,顾名思义,垂直;也就是说,一个k位计数器存储在k个单词中每个字一个位

  x[0]  00000110   lsb ↑
  x[1]  00000001       |
  x[2]  00000100       |
  x[3]  00000000       |
  x[4]  00000000   msb ↓
             512

对于这样存储的数字,可以使用位运算来

创建一个位图,在对应的位置上有一个1位我们想要增加的计数器,然后从LSB向上循环数组,随着时间的推移不断更新。一个加法的"携带"变成数组下一个元素的输入。

  input  sum
--------------------------------------------------------------------------------
   A B   C S
   0 0   0 0
   0 1   0 1      sum    = a ^ b
   1 0   0 1      carry  = a & b
   1 1   1 1
  carry = input;
  long *p = buffer;
  while (carry) {
    a = *p; b = carry;
    *p++ = a ^ b;
    carry = a & b;
  }

对于64位字,循环将平均运行6-7次——迭代次数由最长的进位链决定。

您可以像这样展开函数。它可能比编译器所能做的要快!

//   rax as 64 bit input
   xor  rcx, rcx                //clear addent
   add  rax, rax                //Copy 63th bit to carry flag
   adc  dword ptr [@bit_counter + 63 * 4], ecx    //Add carry bit to counter[64]
   add  rax, rax                //Copy 62th bit to carry flag
   adc  dword ptr [@bit_counter + 62 * 4], ecx    //Add carry bit to counter[63]
   add  rax, rax                //Copy 62th bit to carry flag
   adc  dword ptr [@bit_counter + 61 * 4], ecx    //Add carry bit to counter[62]
//   ...
   add  rax, rax                //Copy 1th bit to carry flag
   adc  dword ptr [@bit_counter + 1 * 4], ecx     //Add carry bit to counter[1]
   add  rax, rax                //Copy 0th bit to carry flag
   adc  dword ptr [@bit_counter], ecx             //Add carry bit to counter[0]
编辑:

你也可以尝试这样的双增量:

//   rax as 64 bit input
   xor  rcx, rcx                //clear addent
//
   add  rax, rax                //Copy 63th bit to carry flag
   rcl  rcx, 33                 //Mov carry to 32th bit as 0bit of second uint
   add  rax, rax                //Copy 62th bit to carry flag
   adc  qword ptr [@bit_counter + 62 * 8], rcx  //Add rcx to 63th and 62th counters
   add  rax, rax                //Copy 61th bit to carry flag
   rcl  rcx, 33                 //Mov carry to 32th bit as 0bit of second uint
   add  rax, rax                //Copy 60th bit to carry flag
   adc  qword ptr [@bit_counter + 60 * 8], rcx  //Add rcx to 61th and 60th counters
//...

您可以使用一组计数器,每个计数器的大小不同。首先在2位计数器中累积3个值,然后解包它们并更新4位计数器。当15个值准备好时,解包为字节大小的计数器,在255个值之后更新bit_counter[]。

所有这些工作都可以在128位SSE寄存器中并行完成。在现代处理器上,只需要一条指令就可以将1位解包为2位。只需将源四字与PCLMULQDQ指令相乘即可。这将使源位与零交错。同样的技巧可以帮助将2位解包为4位。4位和8位的解包可以通过洗牌、解包和简单的逻辑操作来完成。

平均性能似乎很好,但代价是额外的计数器120字节和相当多的汇编代码。

一般来说没有办法回答这个问题;这完全取决于编译器以及底层架构。唯一真正知道的方法就是去尝试不同的解决方案和测量。(例如,在某些机器上,轮班可能非常昂贵。在其他方面,没有。)首先,我会用例如:

uint64_t mask = 1;
int index = 0;
while ( mask != 0 ) {
    if ( (bits & mask) != 0 ) {
        ++ bit_counter[index];
    }
    ++ index;
    mask <<= 1;
}

完全展开循环可能会提高性能。根据体系结构,将if替换为:

bit_counter[index] += ((bits & mask) != 0);

可能更好。或者更糟……提前知道是不可能的。这是也有可能在某些机器上,系统地切换到低阶位和掩码,如你所做的,是最好的。

一些优化还将取决于典型数据的样子。如果大多数单词只有一个或两个位,你可能会受益每次测试一个字节,或者一次测试四个比特,然后跳过这些都是0。

如果计算每次偏移(16种可能性)发生的次数(16种可能性),您可以轻松地将结果相加。这256个总和很容易保存:

unsigned long nibble_count[16][16]; // E.g. 0x000700B0 corresponds to [4][7] and [2][B]
unsigned long bitcount[64];
void CountNibbles(uint64 bits) {
  // Count nibbles
  for (int i = 0; i != 16; ++i) {
     nibble_count[i][bits&0xf]++;
     bits >>= 4;
  }
}
void SumNibbles() {
  for (int i = 0; i != 16; ++i) {
    for (int nibble = 0; nibble != 16; ++nibble) {
        for(int bitpos = 0; bitpos != 3; ++bitpos) {
           if (nibble & (1<<bitpos)) {
              bitcount[i*4 + bitpos] += nibble_count[i][nibble];
           }
        }
     }
   }
}

这是相当快的:

void count(uint_fast64_t bits){
    uint_fast64_t i64=ffs64(bits);
    while(i64){
        bit_counter[i64-1]++;
        bits=bits & 0xFFFFFFFFFFFFFFFF << i64;
        i64=ffs64(bits);
    }
}

你需要一个快速实现64位的ff。对于大多数编译器和CPU来说,这是一条指令。对于字中的每个位执行一次循环,因此bits=0将非常快,而1的64位将会较慢。

我在64位Ubuntu和GCC下测试了这个,它产生的数据输出与你的:

void Count(uint64 bits) {
  bit_counter[0] += (bits >> 0) & 1;
  bit_counter[1] += (bits >> 1) & 1;
  // ..
  bit_counter[63] += (bits >> 63) & 1;
}

速度根据64位字中1位的个数而变化。