gcc编译器无法安装R包lpSolve

gcc compiler fails for R package installation lpSolve

本文关键字：lpSolve 安装 编译器 gcc      更新时间：2023-10-16

当gcc在R.中编译lpSolve时，我收到一个"-Werror=format security"错误

我使用的是Ubuntu 12.04（lubuntu内核）和R 3.1.0版本。

这是确切的错误：

   * installing *source* package ‘lpSolve’ ...
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I . -DINTEGERTIME -DPARSER_LP -DBUILDING_FOR_R -DYY_NEVER_INTERACTIVE -DUSRDLL -DCLOCKTIME -DRoleIsExternalInvEngine -DINVERSE_ACTIVE=INVERSE_LUSOL -DINLINE=static -DParanoia     -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c colamd.c -o colamd.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I . -DINTEGERTIME -DPARSER_LP -DBUILDING_FOR_R -DYY_NEVER_INTERACTIVE -DUSRDLL -DCLOCKTIME -DRoleIsExternalInvEngine -DINVERSE_ACTIVE=INVERSE_LUSOL -DINLINE=static -DParanoia     -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c commonlib.c -o commonlib.o
commonlib.c: In function ‘blockWriteINT’:
commonlib.c:691:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
commonlib.c: In function ‘blockWriteBOOL’:
commonlib.c:710:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
commonlib.c: In function ‘blockWriteREAL’:
commonlib.c:732:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
cc1: some warnings being treated as errors
make: *** [commonlib.o] Error 1
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I . -DINTEGERTIME -DPARSER_LP -DBUILDING_FOR_R -DYY_NEVER_INTERACTIVE -DUSRDLL -DCLOCKTIME -DRoleIsExternalInvEngine -DINVERSE_ACTIVE=INVERSE_LUSOL -DINLINE=static -DParanoia     -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c commonlib.c -o commonlib.o
commonlib.c: In function ‘blockWriteINT’:
commonlib.c:691:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
commonlib.c: In function ‘blockWriteBOOL’:
commonlib.c:710:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
commonlib.c: In function ‘blockWriteREAL’:
commonlib.c:732:3: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]
cc1: some warnings being treated as errors
make: *** [commonlib.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘lpSolve’
* removing ‘/home/ben/lpSolve.Rcheck/lpSolve’

我已尝试使用R CMD INSTALL手动安装它。我也遵循了这里的指示，但没有用。

谢谢你的光临。

函数中的fprintf发生错误，因此，如果您下载源代码，重新制作包，它就会得到解决。但是lpSolve包装目前是孤立的。该错误可能是由于编译器检查而发生的。这里有一个绕行的方法。

  1. 转到R etc路径（例如/usr/lib/R/etc或/etc/R）
  2. 编辑Makeconf文件：remove-Weror=CFLAGS中的格式安全性。（它是只读文件，因此需要su权限。）
  3. 重新安装程序包：install.package（'lpSolve'）
  4. 如有必要，请还原Makeconf文件

我希望这对你有帮助。

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