在Dirk对这个问题的评论中，我提到了RcppArmadillo使用的configure.ac脚本，以便在构建时用程序检查OS X上是否支持OpenMP。然后我觉得这听起来太复杂了，没有必要，但我尝试了一些方法来避免OpenMP问题，但当我在Travis上测试它时，它似乎仍然存在。

所以我现在做的是：

1.配置.ac

我已经(有点明目张胆，但我当然会尊重GPL-2许可证)将RcppArmadillo使用的配置.ac脚本复制到我的包中，删除了一些部分(例如LAPACK检查)并调整了名称等等

2.Makevars

将src/Makevars重命名为src/Makevars.in，现在读取

PKG_CXXFLAGS = -I../inst/include @OPENMP_FLAG@
PKG_LIBS= @OPENMP_FLAG@ $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)

和src/Makevars.win

PKG_CXXFLAGS = -I../inst/include -I. $(SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS)
PKG_LIBS = $(SHLIB_OPENMP_CFLAGS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)

3.清理

添加了包含的cleanup文件

#!/bin/sh
rm -f config.* src/Makevars src/config.h inst/include/pkgConfigGenerated.h

4.pkgConfigGenerated.h

添加了一个文件inst/include/pkgConfigGenerated.h.in，如下所示：

#ifndef pkg__pkgConfigGenerated__h
#define pkg__pkgConfigGenerated__h
@HAVE_OPENMP@
#endif

5.pkgConfig.h

基于RcppArmadilloConfig.h文件，我创建了inst/include/pkgConfig.h作为

#if defined(WIN32) || defined(_WIN32)
#define ARMA_USE_OPENMP
#else
#include <pkgConfigGenerated.h>
#endif

我的问题：

• 现在我想我需要添加#include <pkgConfig.h>我在src中的cpp文件，因为我认为RcppArmadillo就是这样使用它的。这是正确的吗？当我在Linux上测试它时，它抱怨找不到它：fatal error: pkgConfig.h: No such file or directory。我需要做一些额外的链接吗
• 我还需要做什么吗

工作解决方案

根据德克的回答，我做了以下几点。我从RcppArmadillo借用了configure.ac文件，并包含了我需要的部分，但做了一些小改动(我在这里包含了所有内容，以备将来参考)：

## Copyright Dirk Eddelbuettel for RcppArmadillo (GPL-2)
AC_PREREQ(2.61)
AC_INIT([pkg], 0.1.0)
: ${R_HOME=$(R RHOME)}
if test -z "${R_HOME}"; then
AC_MSG_ERROR([Could not determine R_HOME.])
fi
CXX=$(${R_HOME}/bin/R CMD config CXX)
CXXFLAGS=$("${R_HOME}/bin/R" CMD config CXXFLAGS)
AC_LANG(C++)
AC_REQUIRE_CPP
openmp_flag=""
openmp_cflag=""
AC_MSG_CHECKING([for macOS])
RSysinfoName=$("${R_HOME}/bin/Rscript" --vanilla -e 'cat(Sys.info()[["sysname"]])')
if test x"${RSysinfoName}" == x"Darwin"; then
AC_MSG_RESULT([found])
AC_MSG_WARN([OpenMP unavailable and turned off.])
openmp_flag="-DARMA_DONT_USE_OPENMP"
else
AC_MSG_RESULT([not found as on ${RSysinfoName}])
AC_MSG_CHECKING([for OpenMP])
allldflags=$(${R_HOME}/bin/R CMD config --ldflags)
hasOpenMP=$(echo ${allldflags} | grep -- -fopenmp)
if test x"${hasOpenMP}" == x""; then
AC_MSG_RESULT([missing])
openmp_flag="-DARMA_DONT_USE_OPENMP"
else
AC_MSG_RESULT([found])
openmp_flag='$(SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS)'
openmp_cflag='$(SHLIB_OPENMP_CFLAGS)'
fi
fi
AC_SUBST([OPENMP_CFLAG], ["${openmp_cflag}"])
AC_SUBST([OPENMP_FLAG], ["${openmp_flag}"])
AC_CONFIG_FILES([src/Makevars])
AC_OUTPUT

我的主要错误是，我认为在这个configure.ac文件上会自动调用autoconf来获得configure，但事实并非如此

对应的Makevars.in是

PKG_CXXFLAGS = @OPENMP_FLAG@
PKG_LIBS= @OPENMP_CFLAG@ $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)

(也许这两个标志可以简化为一个，但不要修复没有损坏的…)

现在我通过了Linux和OS X上的构建(当RcppArmadillo安装失败时，OS X和devel版本的R除外，但这似乎是一个不同的问题)。