致命错误：mpi.h：没有这样的文件或目录 #include < mpi.h>

fatal error: mpi.h: No such file or directory #include <mpi.h>

本文关键字：mpi #include gt lt 文件 致命错误      更新时间：2023-10-16

当我编译我的脚本时

#include <mpi.h>

它告诉我没有这样的文件或目录。但是当我将 mpi.h 的路径包含在内时

#include "/usr/include/mpi/mpi.h"

（路径正确）它返回：

In file included from /usr/include/mpi/mpi.h:2087:0,
                 from lbm.cc:7:
/usr/include/mpi/openmpi/ompi/mpi/cxx/mpicxx.h:35:17: fatal error: mpi.h: No such file or directory
 #include "mpi.h"
                 ^
compilation terminated.

有人知道如何解决这个问题吗？

问题几乎可以肯定是你没有使用MPI编译器包装器。每当编译 MPI 程序时，都应使用 MPI 包装器：

  • C - mpicc
  • C++ - mpiCC、mpicxx、mpic++
  • 福特兰 - mpifort ， mpif77 ， mpif90

这些包装器为您完成所有繁琐的工作，以确保在编译程序时包含所有适当的编译器标志、库、包含目录、库目录等。

在我的系统上，我只是缺少Linux软件包。 

sudo apt install libopenmpi-dev
pip install mpi4py

（使用它的东西的例子是一个很好的即时测试，看看它是否成功）

成功了。

您可以执行：

$ mpicc -showme

结果：

gcc -I/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/include -L/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/lib -lmp

此命令显示编译 mpicc 所需的库

例：

$ mpicc -g  -I/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/include -o [nameExec] [objetcs.o...] [program.c] -lm

$ mpicc -g  -I/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/include -o example file_object.o my_program.c otherlib.o -lm

此命令生成可执行文件与您的程序为例，您可以执行：

$ ./example

在我的系统上 Ubuntu 16.04。我安装了：

sudo apt install libopenmpi-dev

在我使用 mpiCC 编译并且它可以工作

之后

如上所述，包含 

/usr/lib/openmpi/include

在包含路径中处理这个问题（在我的情况下）

Debian 似乎包括以下内容：

  • mpiCC.openmpi
  • mpic++.openmpi
  • mpicc.openmpi
  • mpicxx.openmpi
  • MPIF77.openmpi
  • MPIF90.openmpi

我将测试每个mpic等的符号链接，看看这是否有助于启用HDF5-openmpi之类的找到mpi.h。

拿回去吧，Debian 通过他们的替代系统包含符号链接，它仍然无法在 HDF5 openmpi 软件包和 H5public.h 标头中引用的 mpi.h 之间找到正确的路径。

在 Ubuntu 18.04 上，我必须安装：

sudo apt install lam4-dev

在 Fedora 上：

dnf install openmpi-devel

在 Ubuntu 20.04 上，这对我有用：

apt -y install lam-runtime

在 Mac 12.2 上，我安装了 brew install openmpi .头文件位于 /opt/homebrew/Cellar/open-mpi/x.x.x/include 下。

一旦安装了 MPI：

$ sudo apt install mpich

查看库的安装位置，每种情况都不同：

$ mpicc -show

就我而言：（Ubuntu 20.0）

并添加...

#include </usr/lib/x86_64-linux-gnu/openmpi/include/openmpi>

：-）

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