HDF5 (c++)中的大属性

Large Attributes in HDF5 (C++)

本文关键字：属性 c++ HDF5      更新时间：2023-10-16

我正在使用hdf5c++ API。我有一个程序，偶尔需要编写大于64 kB的属性。当试图写这么大的属性时，会抛出H5::AttributeIException。

HDF5文档提到了两种存储大属性的方法。第一个选项是密集存储(我认为从1.8.8版本开始可用)，而第二个选项是将属性中的数据卸载到另一个数据集，并在属性中存储对该数据集的引用。第二个选项应该是向后兼容的，而第一个选项破坏了与1.8.8之前的HDF5版本的兼容性。

不幸的是，似乎没有任何关于如何在c++中实现这些选项的文档。我试图通过将C API与c++ API结合来破解第一种选择。下面是我的尝试，基于这里的密集存储示例:

hid_t dID = dataset->getId();
herr_t res = H5Pset_attr_phase_change(dID, 0, 0);
if(res < 0) {
    std::cerr << "Failed to specify dense storage." << std::endl;
}

这里，dataset是一个H5:: dataset对象。此代码无法设置密集存储，因为res总是为负。我认为这可能是由于我没有指定像H5F_LIBVER_LATEST这样的东西，就像在密集存储的C示例中所做的那样:

fpid = H5Pcreate (H5P_FILE_ACCESS);
status = H5Pset_libver_bounds (fpid, H5F_LIBVER_LATEST, H5F_LIBVER_LATEST);
fid = H5Fcreate("adense.h5", H5F_ACC_TRUNC, H5P_DEFAULT, fpid);

我在c++ API中找不到任何方法来指定H5F_LIBVER_LATEST。FileAccPropList类没有任何类似于set_libver_bounds的成员函数，据我所知，从文档中可以看出。

至于第二个选项，即将属性存储为对辅助数据集的引用，我不知道从哪里开始，因为在c++文档中没有这样的示例。

有没有人知道如何实现密集存储，或存储属性作为引用的数据集在c++ ?

H5::FileAccPropList有一个重载的构造函数，允许对象继承(或者更确切地说是包装)一个使用C API创建的现有文件访问属性列表。所以你应该可以这样做:

hid_t fapl = H5Pcreate(H5P_FILE_ACCESS);
H5Pset_libver_bounds(fapl, H5F_LIBVER_LATEST, H5F_LIBVER_LATEST);
H5::FileAccPropList faplObj(fapl);
...

以后参考:

有一个方法可以设置库版本(使用c++ API):

void H5::FileAccPropList::setLibverBounds   (H5F_libver_t   libver_low,
                                             H5F_libver_t   libver_high 
                                            ) const
链接:

(没有足够的代表性来评论问题)。

属性的密集存储特性是根据https://support.hdfgroup.org/HDF5/doc/RM/RM_H5P.html#Property-SetAttrPhaseChange在HDF5 1.8.0版本中引入的。

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