将源文件位置移到Visual Studio 2012之外

我想把一些源文件分组到一个文件夹中以便更好地组织，但是visual studio一旦移动就不会识别它们，文件路径不能从VS内部更改(至少我不知道是否有办法这样做)。除了排除文件并重新添加它们之外，还有更好的方法吗?一旦你有很多文件，这样做是非常乏味和痛苦的。有什么建议吗?

例如，在我的解决方案中，我有stdafx.h, stdafx.cpp和resource.h直接在根目录下，而在VS中它显示在头文件夹下。我想做的是在根目录下创建一个实际的Header文件夹，并将它们移动到该文件夹中。

编辑:如果我在构建期间通过排除和重新包含文件来这样做，我会得到这个错误:

cannot overwrite information formed during creation of the precompiled header in object file stdafx.obj

这个stdafx.h文件是随着win32应用程序项目的创建而自动存在的，我听说我应该在设置下创建预编译的头文件。因此，我将stdafx.cpp设置为Yc(创建预编译头文件)，并将所有其他.cpp文件设置为Yu(使用预编译头文件)。但是，当构建错误信息说fatal error C1083: Cannot open include file: 'stdafx.h'。但事实是，stdafx.h是正确的头文件夹下的根目录，并包括从该文件夹，它可以在VS中打开，但仍然有读取行下，包括语句，因此错误。