HDF5 Cpp -检索所有组的名称在一个文件

HDF5 Cpp - retrieving the names of all groups in a file

本文关键字:文件 一个 检索 Cpp HDF5      更新时间:2023-10-16

我尝试读取并保存一个文件中所有组的名称(在文件的根组中)。因此,我使用H5Literate来遍历根组中的所有对象。

我的问题是,我可以打印组的名称,但我不知道如何将它们保存在数组中。

我的运算符函数是这样的:

extern "C" herr_t file_info(hid_t loc_id, int *mom, string *Moments, const char *name, const H5L_info_t *linfo,
void *opdata);
{
hid_t group;
group = H5Gopen2(loc_id, name, H5P_DEFAULT);
cout << "Name : " << name << endl;
Moments[mom]=name;
H5Gclose(group);
mom++;
return 0;
}

迭代如下:

Group *rootGr = new Group (file->openGroup("/"));
    hsize_t numMom = rootGr->getNumObjs();
    string Moments[numMom];
    int mom=0;
    herr_t idx = H5Literate(rootGr->getId(), H5_INDEX_NAME, H5_ITER_INC, NULL, file_info, NULL);

cout工作,但我得到一个错误时,试图在Moments[mom]保存名称。

怎么了?

编辑:错误是:

invalid conversion from 'herr_t (*)(hid_t, int*, std::string*, const char*, const H5L_info_t*, void*) {aka int (*)(int, int*, std::basic_string<char>*, const char*, const H5L_info_t*, void*)}' to 'H5L_iterate_t {aka int (*)(int, const char*, const H5L_info_t*, void*)}' [-fpermissive]    C/C++ Problem
Invalid arguments '
Candidates are:
int H5Literate(int, enum H5_index_t, enum {H5public.h:9387}, unsigned long long int *, int (*)(int, const char *, const {H5Lpublic.h:3236} *, void *), void *)
    Semantic Error
invalid types 'std::string* {aka std::basic_string<char>*}[int*]' for array subscript   C/C++ Problem
  initializing argument 5 of 'herr_t H5Literate(hid_t, H5_index_t, H5_iter_order_t, hsize_t*, H5L_iterate_t, void*)' [-fpermissive] C/C++ Problem
编辑2:

I fixed it:

我添加了一个全局

std::vector<string> GroupNames;

那么我的运算符函数是这样的:

herr_t
file_info(hid_t loc_id, const char *name, const H5L_info_t *linfo, void *opdata)
{
hid_t group;
group = H5Gopen2(loc_id, name, H5P_DEFAULT);
GroupNames.push_back(name);
cout << "Name : " << name << endl;
H5Gclose(group);
return 0;
}

即使全局变量"有效",您也应该通过void指针传递数据。

herr_t
file_info(hid_t loc_id, const char *name, const H5L_info_t *linfo, void *opdata)
    {
    hid_t group;
    auto group_names=reinterpret_cast< std::vector<std::string>* >(opdata);
    group = H5Gopen2(loc_id, name, H5P_DEFAULT);
    //do stuff with group object, if needed
    group_names->push_back(name);
    cout << "Name : " << name << endl;
    H5Gclose(group);
    return 0;
    }

新的调用变成

 std::vector<std::string> group_names;
 herr_t idx = H5Literate(rootGr->getId(), H5_INDEX_NAME, H5_ITER_INC, NULL, file_info, &group_names);

额外练习:如果group_names->push_back(name)抛出怎么办?